Babylon, ну это можно следующим образом объяснить. Был Т‑3, где дамочка программировала роботов для уничтожения людей военного центра. Вполне возможно, что она получила доступ и в скайнет, чем вызвала у системы такое неприятие к пока неизвестному Коннору.